一、场景驱动选择模型

根据全球实验室选择DNA测序技术的决策树数据（Nature,2023），90%的技术误用源于场景匹配错误。我们构建了"3W+2H"选择框架：

??What??：样本类型（微生物/人类/动植物）
??Why??：应用目标（诊断突变/物种鉴定/表观分析）
??Where??：数据交付场景（科研/临床/司法）
??How Much??：预算与时效（常规/加急）
??How Deep??：检测深度要求（全基因组/目标区域）

二、五大场景技术适配方案

▎场景1：临床单基因诊断

??技术方案??：Sanger测序

• 适用：BRCA1/EGFR等已知位点验证
• 数据：单次运行≤800bp，准确性99.99%
• 案例：某三甲医院遗传科使用ABI 3500Dx，3日完成耳聋基因确诊

▎场景2：病原微生物鉴定

??技术方案??：Illumina MiSeq

• 适用：未知病原体宏基因组检测
• 数据：2×300bp双端读长，15小时完成
• 案例：某疾控中心破解新型肠道病毒，48小时锁定病原

▎场景3：癌症早筛Panel检测

??技术方案??：NovaSeq 6000

• 适用：578基因肿瘤相关突变扫描
• 数据：日均产出6T数据，成本<$0.01/Mb
• 案例：某体检中心早筛方案，检出率提升至92.3%

▎场景4：动植物基因组组装

??技术方案??：PacBio HiFi

• 适用：复杂基因组重复区域解析
• 数据：15-20kb读长，Q30>99%
• 案例：某农科院完成野生稻T2T基因组，发现抗病新基因

▎场景5：单细胞甲基化分析

??技术方案??：Oxford Nanopore

• 适用：实时表观遗传研究
• 数据：直接读取甲基化信号，无需亚硫酸盐处理
• 案例：某肿瘤研究所揭示癌细胞耐药新机制

三、决策避坑指南（附自查清单）

1. ??数据陷阱??：NGS的80x覆盖深度≠有效深度（实际需扣除重复序列）
2. ??成本误区??：三代测序单次成本下降67%，但建库费用仍占45%
3. ??时效盲区??：快速建库试剂盒可缩短12小时，但会损失20%数据量

实操建议：临床诊断优先CLIA认证方案，科研场景关注Nature Methods年度技术评测指标

四、技术迭代预警（2024风向）

1. 国产化平台崛起：华大智造DNBSEQ-T202单机年数据量达50Pb
2. 纳米孔技术突破：Q20+准确率已实现临床级应用
3. 智能算法替代：DeepConsensus模型纠错效率提升300%

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图示：基于1000+实验室选择的决策模型（数据来源：GEN Reports）

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