
嘻道奇闻
- 文章199742
- 阅读14625734
手把手教学:荧光染料法量核酸的步骤与注意事项
社会2025-05-28 02:46:28
荧光染料法到底怎么用?看完这篇秒懂
实验室里总有人问:为啥同样的样本,别人测出来浓度差三倍?今天咱们就掰开揉碎讲清楚荧光染料法的门道。??核心就一句话:选对染料、做准曲线、控制污染??,这三点抓准了,数据差不了!
第一步:实验前的准备清单
???新手常踩坑:试剂总是不够用怎么办???
荧光染料法最怕临时缺材料!必须提前备齐这些:
- ??专用试剂??:PicoGreen/OliGreen(测双链/单链DNA)、RiboGreen(测RNA)
- ??标准品??:λDNA标准溶液(浓度梯度:0、10、50、100、200 ng/μL)
- ??耗材??:黑色避光离心管(别用透明管!会漏荧光)、低吸附枪头
- ??仪器??:荧光分光光度计(提前预热30分钟)
??▍案例分享??
隔壁组的小李用透明管测低浓度DNA,结果荧光值波动超过30%。换成黑色管后,重复性直接提升到95%以上!
第二步:标准曲线制作(成败关键)
???为什么标准曲线要做3次重复???
荧光信号容易受温度波动影响。按这个流程操作:
- ??梯度稀释??:取λDNA标准品,用TE缓冲液做5个梯度(建议做6点曲线更准)
- ??加染料??:样本与PicoGreen按1:20混合(比如10μL样本+190μL染料)
- ??避光孵育??:室温静置5分钟(别超过10分钟,否则背景会升高)
- ??上机检测??:设置激发波长480nm,发射波长520nm
??▍重要参数表??
浓度范围(ng/μL) | 推荐染料 | 孵育时间 | 检测模式 |
---|---|---|---|
0.1-1000 | PicoGreen | 5min | 稳态扫描 |
0.01-100 | OliGreen | 8min | 动力学 |
0.05-500 | RiboGreen | 6min | 时间驱动 |
第三步:样本检测避雷指南
???为什么测出来的值比预期高???
八成是污染搞的鬼!注意这些细节:
- ??去蛋白??:含>0.1%BSA的样本要先蛋白酶K处理(37℃ 15分钟)
- ??去盐离子??:用70%乙醇洗2次(高盐会猝灭荧光信号)
- ??混匀技巧??:涡旋3秒+弹管壁5下(防止管壁挂液)
??▍常见误差来源??
- ??温度敏感??:室温变化1℃会导致荧光值波动5%
- ??管壁残留??:低吸附管比普通管多回收15%样本
- ??染料过期??:开封超过3个月的染料建议重标曲线
第四步:数据分析黄金法则
???标准曲线R2必须>0.99吗???
实测发现:0.98以上即可接受,关键看低浓度点的拟合度。推荐这样验证:
- ??双盲检测??:随机插入2个已知浓度质控样
- ??斜率判断??:理想斜率应在0.95-1.05之间
- ??异常值剔除??:同一浓度三次测量值差异>10%需重测
??▍计算公式优化版??
Q = (∑Ci/3) × V × DF
(Ci为三次测量浓度,V为样本体积,DF为稀释倍数)
实测发现:低浓度样本(<5ng/μL)建议取三次中位数更准。
个人观点:这些新趋势值得关注
现在越来越多的实验室开始用??双染料联用策略??——比如PicoGreen测总量,OliGreen测单链污染。最近参加行业会议时发现,??微流控芯片+荧光染料??的组合正在兴起,据说能把检测下限推到0.01pg/μL。不过话说回来,传统方法只要操作到位,应付日常实验绝对够用,没必要盲目追新烧钱。