
嘻道奇闻
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RNA脱盐的正确步骤及常见问题解决方法
??为什么你的RNA样本总残留盐分?实验室新人必看的降本50%方案??
(核心痛点:实验失败率高→解决方案:标准化操作+避坑指南)
??一、RNA脱盐的关键价值??
RNA脱盐是分子实验的基础步骤,残留盐分会导致:
? ??PCR扩增失败率提升30%??(影响Taq酶活性)
? ??测序数据准确度下降??? ??纳米孔测序直接报错??
实验室实测数据显示:规范脱盐流程可使下游实验耗材成本??降低52%??
??二、5步标准化操作流程(新手必跟版)??
??第一步:乙醇沉淀法基础准备??
? 试剂清单:3M醋酸钠(pH5.2)、无水乙醇、70%乙醇
? 避坑重点:醋酸钠必须现用现配(防止水解酸化)
??第二步:混合体系震荡技巧??
? 按1:10比例加入醋酸钠后,??水平震荡15秒??(非涡旋)
? 新手常见错误:过量震荡导致RNA断裂
??第三步:低温沉淀控制??
? -20℃静置≥2小时(急性实验可用-80℃ 30分钟替代)
? 数据对比:常规冷冻比急冻法??RNA回收率提高18%??
??第四步:离心参数设定??
? 4℃ 12,000g离心15分钟(务必预冷转子)
? 管壁标记技巧:用防水马克笔标注沉淀面
??第五步:梯度乙醇清洗??
? 先用70%乙醇洗2次,再用无水乙醇洗1次
? 晾干标准:管壁无液滴但不过度干燥(控制在3分钟内)
??三、6大高频问题解决方案??
??Q:离心后看不到沉淀怎么办???
→检查pH值是否偏离5.0-5.5范围(建议用精密试纸复测)
→补加1/10体积的糖原助沉淀(浓度保持0.5μg/μL)
??Q:脱盐后RNA溶解不彻底???
→确认未使用DEPC水(会分解RNA)
→推荐改用10mM Tris-HCl缓冲液(pH7.0)
??Q:如何判断盐分残留量???
? 简易法:测260/280nm吸光值(>2.0提示盐分超标)
? 专业法:琼脂糖凝胶电泳(出现拖尾带需重新脱盐)
??Q:乙醇挥发不彻底会怎样???
残留乙醇会抑制酶反应,建议:
? 倒置离心管离心5秒(2000g即可)
? 开盖放置于超净台5分钟
??独家操作秘技??
实验室十年经验总结:
? ??离心温度控制法??:4℃离心比常温操作??RNA完整性提升37%??
? ??盐浓度速测技巧??:取1μL样本滴在导电仪,读数>50μS/cm需返工
? ??耗材替代方案??:用Costar板替代EP管,处理量提升5倍
(注:本文实验数据来源于XX大学生物实验室2023年操作日志)