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质粒DNA提取详细步骤及常见错误避免指南
社会2025-05-27 12:42:07
你是不是刚进实验室,连离心机按钮都找不着北?或者看着师兄师姐咔咔提DNA,自己一上手就搞出黏糊糊的“鼻涕状”产物?别慌!今天咱们就像聊“新手如何快速涨粉”那样,把质粒提取这摊子事掰碎了说。说白了,这就是个细菌掏硬币的游戏——咱们要把它肚子里藏的质粒小硬币给摸出来。
??一、开工前先认家伙事儿??
实验台摆上这些玩意儿:1.5ml离心管(建议用进口的,国产老漏液)、涡旋振荡器(转得越猛越好)、水浴锅(温度准不准直接决定成败)、还有最烧钱的核酸检测仪。对了!新手最容易忘的是提前给离心管标号,上次隔壁组小王没写标签,三组样品全混了,被导师追着骂了三条走廊。
??二、手把手走流程??
- ??细菌培养??:挑单菌落扔LB培养基里晃12小时。这里有个坑:新手总以为菌液越浑浊越好,其实OD600到0.6就得停手,再养下去菌老化了会释放杂质。
- ??裂解细菌??:加Solution I/II/III这三兄弟时,手腕要像摇鸡尾酒那样转管子。重点来了!Solution II(碱性裂解液)接触菌液绝对不能超过5分钟,否则质粒DNA会断成渣。
- ??硅胶膜吸附??:把裂解液怼进离心柱那会,新手容易手抖洒出来。记住啊,每次转移液体至少要留2mm管口,不然吸头一戳就溅得到处都是。
- ??洗脱阶段??:用预热的TE缓冲液更能提高得率。见过有人拿凉TE冲了半小时,最后测浓度跟白开水似的——温度不够DNA压根不脱落。
??三、翻车现场大揭秘??
- ??为啥我的质粒像果冻??? 八成是蛋白质没去除干净。下次试试加完Solution III后冰浴10分钟,让杂质蛋白结块更彻底。
- ??浓度总比别人低??? 检查洗脱液用量!50μl TE缓冲液洗两次,比200μl洗一次能多薅30%的DNA。
- ??跑胶出现三条带??? 这不是质粒降解,是正常现象。超螺旋、开环、线性三种形态在胶上就是会排排坐,别傻乎乎地重做实验了。
??四、自问自答环节??
Q:离心机参数不会调怎么办?
A:记住三组黄金数值:12,000rpm裂解离心、8,000rpm结合硅胶膜、10,000rpm洗脱。转速单位要是换成×g的话,不同机器得重新换算,建议直接看离心管架上的刻度对照表。
Q:试剂盒品牌选哪个不踩雷?
A:TIANGEN的普通提法够用,康为世纪的适合做转化,要是提大质粒(>15kb)必须用Omega的HiPure系列。别信宣传页吹的天花乱坠,实验室前辈们用顺手的才是真理。
Q:没测浓度能做后续实验吗?
D:作死行为!上次有人没测浓度直接做酶切,结果酶加多了把质粒切稀碎。实在没仪器的话,取2μl样品跑个琼脂糖胶,跟λDNA标准品对比下亮度也能估个大概。
小编观点:其实做实验就跟炒菜一个道理,火候过了会焦,火候不到夹生。质粒提取这活计,关键就是卡准裂解时间和离心力度。刚开始手生正常,多提两板大肠杆菌,保管你闭着眼睛都能玩转那些离心管。哪天要是提烦了,想想这些质粒能换发文章能毕业,是不是突然又有动力了?